抗體片段化，就是用工具（蛋白酶及化學物質）將抗體分子切成特定大小的片段。Why？因為在實際運用時，抗體分子真的太大了！抗體分子的分子量一般為幾百道爾頓（例如IgM五聚體就更龐大了），分子直徑在10 nm~15 nm之間，而制備成抗體片段后，就呈現(xiàn)出各自的優(yōu)勢。

                                          各類型抗體及抗體片段的分子量

抗體片段特性及功能
抗體片段化后，因去掉了某些功能結構域以及分子量的改變，具有與全長抗體不同的特性：
1、顯著降低Fc的非特異性結合；
2、沉淀和免疫印跡中可降低抗體與proteinA、proteinG的結合；
3、更好的組織滲透性，免疫組化實驗中染色效果更優(yōu)異；
4、避免全長抗體的空間位阻效應，在固相抗原檢測中靈敏度更高；
5、在抗原-抗體結合研究中可避免Fc相關作用因子的干擾；
6、X-射線晶體學或核磁共振研究免疫識別的結構基礎時系統(tǒng)更加簡化；
7、體內實驗時相對全長抗體具有更低的免疫原性；
8、能偶聯(lián)或結合酶、毒素、藥物及放射性核素等。
抗體片段的這些優(yōu)勢可使其很好地應用于免疫化學技術、臨床診斷及治療等領域。

                                              IgG、IgM各結構域功能及各片段的特性    

IgG片段化工具
木瓜蛋白酶Papain
來源于女生*的水果—番木瓜，非特異性的巰基蛋白內切酶，分子量23 kDa，它在還原劑的存在下能將IgG切割成三個片段：2個Fab片段和1個Fc片段，最適反應pH6.5。木瓜蛋白酶最初是被用于制備Fab片段，不過它也可以用來制備F(ab')2片段，但是需要將其先用半胱氨酸活化，然后*去掉半胱氨酸再和IgG共同孵育。但是得到的F(ab')2片段并不均一，而且如果有半胱氨酸存在很容易過度切割。
胃蛋白酶Pepsin
由胃粘膜主細胞（gastric chief cell）分泌，非特異性的巰基蛋白內切酶，分子量35 kDa，它能將IgG切割成1個F(ab')2片段加Fc的多肽碎片（Fc’，可通過透析等方法除去），在中性及堿性環(huán)境下會不可逆失活，最適反應pH1.0。F(ab')2片段在溫和的還原劑（如2-Mercaptoethylamine•HCl，2-MEA）作用下可得到2個單價的含巰基的Fab‘片段，這些片段因為自帶巰基可以用來偶聯(lián)檢測標記物而不影響片段的結合活性，當然也可以用N-Ethylmaleimide (NEM)將巰基保護起來防止再次形成F(ab')2。
無花果蛋白酶
來源于無花果樹的膠乳和不成熟的果實乳汁，非特異性的巰基蛋白酶，分子量26 kDa，它能在4 mM半胱氨酸的環(huán)境下將IgG切割成1個F(ab')2片段加Fc的多肽碎片（Fc’），或者在25 mM半胱氨酸的環(huán)境下將IgG切割成2個Fab片段加Fc的多肽碎片（Fc’），最適反應pH6.4。無花果蛋白酶水解IgG得到的F(ab')2片段大小與胃蛋白酶水解IgG得到的非常接近，而其免疫活性和親和力則與全長IgG1抗體別無二致，在制備鼠類IgG1的片段時無花果蛋白酶是很好的選擇。

                                                                     IgG的片段化   

IgM片段化工具
       不同種屬的IgM片段化產物是有差異的，如鼠和人IgM在單體的連接方式上的不同導致二硫鍵位置的不同使得產物有差異，另外不同物種IgM上寡聚糖修飾的差異也會影響酶的切割，所以不同種屬的IgM進行片段化需要不同的條件，沒有一套通用的方案。
胃蛋白酶Pepsin：可將IgM切割成F(ab')2、Fab和Fv片段。
胰蛋白酶Trypsin：絲氨酸蛋白酶，最適反應pH8.0?？蓪gM切割成F(ab')2、Fab、IgG型和Fc5片段。
化學試劑：2-MEA可將IgM處理成"IgG"型片段或/和還原型IgG ("rIgG"）片段。對小鼠IgM控制還原條件可以產生反轉的"IgG"型片段

                                              IgM的片段化